СМК координирует внедрение и функционирование СМК в отделах и подразделениях. СМК направлена на обеспечение методологической и информационной поддержки качества СМК и образовательных услуг в структурах университета в соответствии с требованиями стандартов качества ISO 9001: 2015 и соответствие с требованиями руководства по качеству ЕУИК Нур-Мубарак. Отдел осуществляет свою деятельность на основе анализа СМК во всех структурах Университета.

Осуществляется контроль за качеством в соответствии с нормативными документами утвержденным МОН РК, а также правилами управления по контролю в сфере образования. Деятельность отдела СМК основана на политике качества Нур-Мубарак, направленной на повышение качества образовательного процесса, учебно-методическую работу и интеграцию образования, науки и практики.